More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2287 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  861    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  83.45 
 
 		 423 aa  731    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 439 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  47.2 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.03 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.94 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.91 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  44.78 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.79 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 573 aa  244  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  36.47 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  38.7 
 
 		 579 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  33.55 
 
 		 956 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  33.64 
 
 		 884 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  37.01 
 
 		 460 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  34.69 
 
 		 555 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 431 aa  202  9e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 501 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.05 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  31.88 
 
 		 574 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>