More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1139 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 441 aa  903    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  40.19 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.58 
 
 		 430 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  40.19 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.53 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 421 aa  259  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 428 aa  252  9.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  33.84 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 429 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  31.86 
 
 		 956 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  36.05 
 
 		 884 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  30.57 
 
 		 579 aa  222  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.5 
 
 		 567 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  33.33 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  35.92 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  27.59 
 
 		 574 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 442 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  29.57 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>