More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1066 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  881    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 438 aa  359  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 438 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 443 aa  352  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 434 aa  349  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  35.85 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 573 aa  249  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.64 
 
 		 441 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  34.73 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.26 
 
 		 430 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  32.9 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  32.35 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  29.61 
 
 		 567 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 436 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  30.79 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 430 aa  226  9e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.44 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  29.45 
 
 		 956 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 431 aa  212  9e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  32.49 
 
 		 884 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 430 aa  210  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  29.72 
 
 		 555 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  30.99 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  29.79 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>