More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1886 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
432 aa  893    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 
432 aa  578  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 
434 aa  569  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
431 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
430 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
430 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
430 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
448 aa  503  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
431 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
448 aa  489  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
449 aa  482  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
429 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
441 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
441 aa  450  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 
433 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
442 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
435 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
434 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
432 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
431 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
430 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
434 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
434 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
434 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
434 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
430 aa  360  2e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
431 aa  351  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
431 aa  347  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
431 aa  342  5e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
431 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
432 aa  331  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
462 aa  301  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
466 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
466 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
466 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
466 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
460 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
466 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
463 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
464 aa  289  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
463 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
466 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
472 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
463 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
467 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
462 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0096  asparaginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
463 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
460 aa  285  9e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
463 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
466 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
466 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
466 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
465 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
465 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
481 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
466 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
469 aa  279  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
466 aa  279  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
466 aa  279  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
467 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
466 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  33.48 
 
 
503 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
466 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
471 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
466 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>