More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1358 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 
431 aa  658    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  893    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  66.28 
 
 
432 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
430 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
431 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
433 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
431 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
440 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
440 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
430 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
430 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
447 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
440 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
441 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
441 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
434 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
434 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
434 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
434 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
432 aa  436  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
432 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
434 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
435 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
447 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
432 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
431 aa  372  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
430 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
431 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
431 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
431 aa  368  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
430 aa  355  1e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
462 aa  300  4e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
460 aa  293  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
501 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
464 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
462 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
464 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
464 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
465 aa  275  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
466 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
466 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
465 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  37 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
467 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
467 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
467 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
463 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
454 aa  267  2e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
466 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
481 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
466 aa  267  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
472 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
466 aa  266  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
463 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
479 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
463 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
466 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
463 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
464 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
463 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
466 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
466 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
472 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
466 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
466 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
466 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
472 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>