More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0527 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 434 aa  658    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  79.77 
 
 		 432 aa  740    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 431 aa  891    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 433 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 501 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 462 aa  292  9e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 464 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 467 aa  278  9e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 463 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  35.73 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 479 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 481 aa  269  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 466 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 481 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  34.79 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>