More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3597 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  69.53 
 
 
429 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  878    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
431 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 
433 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
430 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 
431 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
430 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
441 aa  511  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
431 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
430 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
440 aa  501  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
441 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
430 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
442 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
431 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
432 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
434 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
434 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
434 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
434 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
434 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
440 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
447 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
432 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
448 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
448 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
432 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
431 aa  371  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
430 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
431 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
431 aa  358  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
430 aa  353  2e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
431 aa  333  3e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
501 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  40 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
466 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
466 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
466 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
466 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
466 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
466 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
466 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
464 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
464 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
463 aa  292  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
472 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
463 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
463 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
481 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  289  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
460 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
467 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
466 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
466 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
463 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
466 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0689  asparaginyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.881016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
472 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
467 aa  286  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
466 aa  286  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
464 aa  286  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
466 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
466 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
463 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
467 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>