More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1900 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  80.68 
 
 		 440 aa  742    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 440 aa  906    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  73.05 
 
 		 447 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  80.68 
 
 		 440 aa  747    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 442 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 430 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 430 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 430 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 448 aa  484  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 501 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 479 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 479 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 466 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 461 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  38.29 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  38 
 
 		 503 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 463 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 467 aa  279  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>