More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4810 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 466 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 472 aa  663    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  68.55 
 
 		 466 aa  678    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 466 aa  668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 465 aa  674    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  68.45 
 
 		 466 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 472 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 		 466 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 481 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 467 aa  687    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  69.1 
 
 		 466 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 		 467 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 466 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  960    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 466 aa  668    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 464 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 466 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  69.1 
 
 		 466 aa  692    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0408  asparaginyl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 467 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 		 466 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 465 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 466 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 		 467 aa  696    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 466 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 466 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  678    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  69.1 
 
 		 466 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 		 464 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  68.45 
 
 		 466 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 466 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  68.76 
 
 		 466 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 466 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  68.45 
 
 		 466 aa  680    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  69.2 
 
 		 466 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  68.98 
 
 		 466 aa  681    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  68.67 
 
 		 466 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 467 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 461 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2412  asparaginyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000151025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 461 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  57.3 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 463 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 463 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 471 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0586  asparaginyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>