More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1133 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  84.92 
 
 
431 aa  749    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  83.06 
 
 
431 aa  748    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  82.13 
 
 
431 aa  745    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
431 aa  868    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 
432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
430 aa  510  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
433 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
431 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
430 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
440 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
440 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
431 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
431 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
431 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
434 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
440 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
430 aa  363  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
430 aa  362  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
430 aa  362  9e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
442 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
429 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
447 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
432 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
434 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
434 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
435 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
434 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
434 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
430 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
441 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
441 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
448 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
448 aa  292  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  38.57 
 
 
553 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
467 aa  272  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
467 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
466 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
467 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
472 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
464 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
464 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
466 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
467 aa  264  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
466 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
466 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
466 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
466 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
466 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
466 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
466 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
466 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
466 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
466 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
481 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
466 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
466 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
466 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
463 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
466 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  37.83 
 
 
574 aa  257  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
466 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
466 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
466 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
466 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
462 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
472 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
471 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
466 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
466 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
466 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
466 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
466 aa  255  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
463 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
466 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
463 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
472 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>