More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33068 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  100 
 
 		 553 aa  1137    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  54.43 
 
 		 574 aa  612  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01390  asparagine-tRNA ligase, putative  52.46 
 
 		 600 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 432 aa  310  5e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 431 aa  301  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 430 aa  280  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 431 aa  273  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 429 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 431 aa  273  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 431 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 430 aa  257  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 433 aa  256  9e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 432 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 434 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 434 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 440 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 448 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 449 aa  236  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 429 aa  228  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 465 aa  223  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 434 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 464 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 430 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 461 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 438 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  30.92 
 
 		 467 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 462 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 438 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 428 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 		 466 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 466 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 432 aa  212  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 463 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2412  asparaginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000151025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 466 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 466 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 466 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 466 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>