More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2111 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  75.35 
 
 
430 aa  701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  74.42 
 
 
430 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  89.02 
 
 
431 aa  813    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  74.42 
 
 
430 aa  688    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  893    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 
435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 
434 aa  560  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
440 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 
429 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
447 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 
440 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
432 aa  552  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
440 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 
442 aa  544  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
432 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
434 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 
433 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
431 aa  524  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
432 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
441 aa  519  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
447 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
441 aa  504  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
430 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 
435 aa  495  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
434 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
434 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
434 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
434 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
430 aa  402  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
432 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
431 aa  380  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
431 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
431 aa  376  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
431 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
430 aa  371  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
501 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
479 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
464 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
462 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
479 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
464 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
438 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
466 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
467 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
462 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
467 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
481 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
465 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
477 aa  281  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
464 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
466 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
454 aa  280  5e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
472 aa  279  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
473 aa  278  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
466 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
475 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
466 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
466 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
466 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
466 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
464 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
466 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
466 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
466 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
466 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
466 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
466 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
466 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
463 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
463 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
464 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
465 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>