More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2442 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 		 476 aa  659    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 479 aa  991    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 		 481 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  67.57 
 
 		 482 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 464 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  76.46 
 
 		 479 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 		 479 aa  685    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02730  asparaginyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 475 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 467 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 		 463 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1706  asparaginyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00283051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 467 aa  541  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 461 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 466 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 466 aa  538  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  53.99 
 
 		 503 aa  532  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 466 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 466 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 466 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 461 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 466 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0586  asparaginyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 468 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2412  asparaginyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000151025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>