More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0848 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  869    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  65.34 
 
 
431 aa  561  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 
431 aa  550  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 
431 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 
432 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
431 aa  537  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
430 aa  473  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
431 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
433 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
430 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
440 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
431 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
429 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
431 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
442 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
440 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
447 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
432 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
430 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
434 aa  379  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
430 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
434 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
431 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
430 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
434 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
434 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
434 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
434 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  42 
 
 
435 aa  350  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
435 aa  349  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
441 aa  349  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
432 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
432 aa  345  7e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
449 aa  332  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
447 aa  325  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
448 aa  319  7e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
448 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  37.3 
 
 
553 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
466 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
466 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
472 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
464 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
471 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2273  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
454 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
462 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
465 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
464 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
467 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
463 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
463 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
467 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
461 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
463 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
472 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
463 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
467 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
466 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
464 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
463 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
467 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
429 aa  262  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
466 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
466 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
461 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
463 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
466 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
467 aa  259  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
472 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
429 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
473 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
463 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
466 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>