More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2020 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  79.37 
 
 
448 aa  760    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
447 aa  925    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  80.27 
 
 
448 aa  770    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
435 aa  542  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
430 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
430 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 
430 aa  524  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
430 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
431 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
434 aa  502  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
447 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
440 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
449 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
440 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
440 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
431 aa  451  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
431 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
429 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
435 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
434 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
432 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
434 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
434 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
434 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
434 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
430 aa  346  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
431 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
431 aa  300  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
430 aa  300  5e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  296  5e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
464 aa  293  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
464 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
481 aa  285  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
462 aa  281  1e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
465 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
462 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
465 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
466 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
466 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
466 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
501 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
466 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  36.99 
 
 
467 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
466 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
464 aa  272  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
471 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
466 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
466 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
466 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
467 aa  267  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
466 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
462 aa  266  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
466 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  35 
 
 
472 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
464 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
479 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
466 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  35 
 
 
466 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
454 aa  264  2e-69  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
466 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
477 aa  263  4e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
466 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
476 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
466 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
472 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
463 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>