More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1136 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
449 aa  914    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 
441 aa  579  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
440 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
431 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
440 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
440 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
431 aa  494  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
432 aa  482  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
435 aa  481  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
430 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
430 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
447 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
430 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
429 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
434 aa  471  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
431 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
432 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
433 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
430 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
448 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
432 aa  333  5e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
430 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
431 aa  322  7e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
430 aa  306  3e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
479 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
465 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
462 aa  291  2e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
481 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
466 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
465 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
466 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
466 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
467 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
466 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
462 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
466 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
472 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
462 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
466 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
466 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
466 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
466 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
466 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
466 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
466 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  36.36 
 
 
503 aa  276  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
461 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
466 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
466 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
473 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
466 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
466 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
463 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
463 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
469 aa  270  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
464 aa  270  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
464 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
466 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
467 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
479 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
467 aa  269  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
466 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>