More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1542 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  895    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  91.16 
 
 
430 aa  838    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  74.42 
 
 
430 aa  688    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
430 aa  895    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  72.9 
 
 
431 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
431 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
435 aa  557  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
434 aa  544  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
447 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
432 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
447 aa  535  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
440 aa  531  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
429 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
448 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
432 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
440 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
442 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
440 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
433 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
431 aa  488  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
434 aa  487  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
441 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
430 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
449 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
432 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
430 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
431 aa  364  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
431 aa  363  3e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
431 aa  362  9e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
431 aa  359  5e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
432 aa  343  4e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
501 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
464 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
464 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
467 aa  296  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
466 aa  296  7e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
462 aa  295  8e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
466 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
466 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
465 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
466 aa  293  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
464 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
471 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
467 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
473 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
466 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
481 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
479 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
466 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
466 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  38 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
466 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
466 aa  289  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
465 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
466 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
466 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
466 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
472 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
462 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
466 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
472 aa  286  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  36.23 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>