More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0885 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  94.09 
 
 
440 aa  862    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
440 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  69.57 
 
 
447 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  80.68 
 
 
440 aa  742    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
431 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 
430 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
442 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
431 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
430 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
433 aa  511  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
430 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
449 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
430 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
434 aa  488  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
441 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
429 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
431 aa  483  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 
435 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
434 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
434 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
434 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
431 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
434 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
448 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
447 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
448 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
435 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  47 
 
 
432 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
501 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
432 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
430 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
431 aa  368  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
431 aa  365  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
430 aa  363  3e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
431 aa  362  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
431 aa  362  1e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
460 aa  285  8e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
467 aa  281  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
462 aa  281  2e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
479 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
462 aa  279  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
465 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
479 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
464 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
466 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
466 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
465 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
466 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
466 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
463 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
463 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
463 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
464 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
467 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
463 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
466 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
463 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
466 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
481 aa  269  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
466 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
466 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
464 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
466 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
466 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
466 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
466 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
463 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
467 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
467 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
466 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
463 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>