More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1381 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 
434 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
435 aa  893    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
430 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 
432 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 
430 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
430 aa  551  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 
448 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
447 aa  542  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 
448 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
440 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
449 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
447 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
431 aa  476  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
441 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  50 
 
 
440 aa  455  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
440 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
435 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
430 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
442 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
434 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
433 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
431 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
432 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
434 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
430 aa  350  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
431 aa  342  8e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
432 aa  341  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
431 aa  335  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  42 
 
 
430 aa  325  1e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
462 aa  323  3e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
431 aa  323  3e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
431 aa  322  9.000000000000001e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
464 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
467 aa  309  6.999999999999999e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
466 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
466 aa  308  9e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
466 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
464 aa  306  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
466 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
466 aa  305  8.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
472 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
466 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  39 
 
 
463 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  39 
 
 
463 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
466 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
466 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
466 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
466 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
471 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
465 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
466 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
466 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
477 aa  299  6e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
466 aa  299  8e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
462 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
467 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
463 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
465 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
465 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
464 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
463 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
467 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
465 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
472 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
464 aa  296  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
467 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>