More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1459 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
501 aa  1028    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
441 aa  500  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
442 aa  478  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
449 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
440 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  45 
 
 
447 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
434 aa  412  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
432 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
430 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
431 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
431 aa  346  7e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
440 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
430 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
430 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
434 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
433 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
429 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
431 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
434 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 
430 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
434 aa  316  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
431 aa  312  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
477 aa  298  1e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
431 aa  293  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
465 aa  293  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
440 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
481 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
432 aa  286  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
434 aa  286  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
463 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
473 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
466 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
466 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
466 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
466 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
466 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
466 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  35.15 
 
 
467 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
447 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
466 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
479 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
466 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
467 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
466 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
466 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
448 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
466 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
466 aa  270  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
466 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
463 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
466 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
472 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
466 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
462 aa  266  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
466 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
463 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
466 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
466 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
467 aa  263  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
466 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
466 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
430 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
466 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
466 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
464 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
463 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
466 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>