More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4215 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 481 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  67.78 
 
 		 479 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 479 aa  984    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 464 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 476 aa  640    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  75.83 
 
 		 479 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 482 aa  665    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0788  asparaginyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 477 aa  621  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.742657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02730  asparaginyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 480 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 463 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 467 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 461 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 461 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 461 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  53.16 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 460 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2273  asparaginyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2054  asparaginyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.424438  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2135  asparaginyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0430278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>