More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2151 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  72.81 
 
 		 424 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  71.63 
 
 		 430 aa  648    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  874    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  73.02 
 
 		 430 aa  660    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 		 429 aa  607  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 434 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 444 aa  531  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 438 aa  488  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 428 aa  343  4e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 432 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 423 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 573 aa  286  5.999999999999999e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 445 aa  279  9e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  38.72 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.36 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  38.95 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  36.18 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.69 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  34.73 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  35.21 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.88 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.23 
 
 		 567 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  36.01 
 
 		 956 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 432 aa  229  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 431 aa  229  8e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 432 aa  229  9e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 430 aa  223  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  30.32 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  33.18 
 
 		 884 aa  219  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  32.48 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  31.74 
 
 		 503 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>