More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1657 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  868    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
434 aa  364  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
429 aa  352  8e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
432 aa  348  9e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
438 aa  346  5e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
434 aa  345  6e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
438 aa  345  7e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
430 aa  342  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
438 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
438 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
438 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
430 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
424 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
432 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
432 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
432 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
432 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
429 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
429 aa  292  9e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
432 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
428 aa  289  8e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
429 aa  285  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
423 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
430 aa  271  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
439 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
428 aa  265  8e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
445 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
421 aa  259  9e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
436 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.71 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.07 
 
 
430 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
436 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  35.45 
 
 
428 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.21 
 
 
437 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
424 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
573 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  32.26 
 
 
884 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  32.68 
 
 
567 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  31.85 
 
 
491 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  34.75 
 
 
447 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  31.95 
 
 
460 aa  209  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  30.91 
 
 
956 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
430 aa  199  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
429 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
442 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  31.28 
 
 
579 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
430 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
430 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
430 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
447 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 
434 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
440 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
432 aa  189  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
430 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
431 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
449 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
435 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 
431 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
431 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
430 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
435 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
447 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  32.52 
 
 
555 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 
431 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 
440 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
441 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
431 aa  176  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  29.72 
 
 
553 aa  173  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
441 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
617 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
460 aa  166  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
591 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
434 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>