More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0770 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  863    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.6 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.99 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.48 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  39.49 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 438 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  39.72 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 444 aa  306  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 429 aa  295  7e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 429 aa  276  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.65 
 
 		 567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  33.55 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  33.85 
 
 		 956 aa  259  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  33.96 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  34.54 
 
 		 555 aa  249  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  36.3 
 
 		 884 aa  247  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  35.07 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  27.85 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  28.51 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>