More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1527 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  881    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  63.05 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  57.89 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  58 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  59.17 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.02 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 432 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 444 aa  279  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 436 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  34.4 
 
 		 567 aa  256  5e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  36.3 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  32.44 
 
 		 956 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  35.15 
 
 		 884 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  32.29 
 
 		 579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  34.93 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  31.91 
 
 		 555 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  31.35 
 
 		 574 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.03 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01390  asparagine-tRNA ligase, putative  30.61 
 
 		 600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 435 aa  162  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 501 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>