More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4171 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 437 aa  863    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  73.36 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  64.29 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  59.04 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  59.36 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.53 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 432 aa  298  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 573 aa  242  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  35.16 
 
 		 884 aa  232  8.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  32.7 
 
 		 567 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 434 aa  222  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  33.7 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  35.89 
 
 		 956 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  31.28 
 
 		 579 aa  206  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  33.82 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  31.6 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  29.32 
 
 		 574 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 447 aa  146  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  27.78 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  29.48 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01390  asparagine-tRNA ligase, putative  28.17 
 
 		 600 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84563  asparaginyl-tRNA synthetase  23.43 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.600288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>