More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0623 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
434 aa  888    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 
444 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
443 aa  551  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 
424 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
430 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
430 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
438 aa  529  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 
429 aa  519  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
438 aa  510  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
438 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
438 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
438 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
434 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
432 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
434 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
430 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
429 aa  404  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
428 aa  384  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
428 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
428 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
429 aa  364  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
429 aa  362  8e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
436 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
432 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
432 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
432 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
432 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
432 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
432 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
432 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
432 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
432 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
423 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
439 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
421 aa  310  5e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
436 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  38.57 
 
 
428 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  37.03 
 
 
491 aa  269  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.92 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.26 
 
 
567 aa  263  6e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
431 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
430 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
431 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
430 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
430 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.5 
 
 
430 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
430 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.24 
 
 
437 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
432 aa  250  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  33.26 
 
 
579 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
442 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
430 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
431 aa  245  9e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  36.72 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
447 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
424 aa  243  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
430 aa  242  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
431 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
441 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
431 aa  240  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  35.42 
 
 
555 aa  239  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
441 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  34.86 
 
 
956 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
432 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
429 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  34.06 
 
 
460 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
431 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
440 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
431 aa  231  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  33.57 
 
 
884 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
449 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
434 aa  225  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
448 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.81 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
432 aa  216  8e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
434 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
434 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
434 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
463 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>