More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3173 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 444 aa  920    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  74.55 
 
 		 443 aa  718    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  62.41 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 429 aa  531  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 424 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 436 aa  334  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  39.81 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  36.53 
 
 		 491 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 573 aa  269  5.9999999999999995e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  39.34 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  35.43 
 
 		 567 aa  266  5e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.16 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 430 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 430 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.12 
 
 		 430 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.51 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  39.38 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  33.41 
 
 		 555 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 431 aa  239  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  31.28 
 
 		 956 aa  226  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  30.42 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 433 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  31.62 
 
 		 884 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  31.64 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>