More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0628 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
421 aa  851    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
434 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
429 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
424 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
438 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
443 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
438 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
430 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
429 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
429 aa  291  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  40 
 
 
434 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
432 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
434 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
429 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
423 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
434 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
430 aa  279  7e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
439 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
423 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
428 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
429 aa  269  5e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
432 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
432 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
432 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
432 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
432 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
432 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
428 aa  263  6e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
432 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
445 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.5 
 
 
441 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
432 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
433 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
434 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.85 
 
 
437 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  34.76 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
424 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
436 aa  239  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  37.14 
 
 
447 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  35.84 
 
 
491 aa  229  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
436 aa  229  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  38.39 
 
 
579 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.07 
 
 
430 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
573 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
430 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
431 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  39.21 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
430 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
430 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  34.3 
 
 
555 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
431 aa  209  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  32.03 
 
 
956 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
431 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
431 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
434 aa  207  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
431 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  35.82 
 
 
884 aa  206  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  36.59 
 
 
567 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
431 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
431 aa  205  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
430 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
432 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
463 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
430 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 
435 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
432 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
463 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2412  asparaginyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
461 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000151025  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
432 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
475 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
435 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
461 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
462 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 
461 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
463 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 
462 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
461 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  30 
 
 
440 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
463 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
463 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
463 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  30.4 
 
 
503 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>