More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77216 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
573 aa  1175    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  56.77 
 
 
567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  52.28 
 
 
555 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  50.91 
 
 
491 aa  495  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  47.42 
 
 
579 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  43.25 
 
 
956 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  47.19 
 
 
460 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  38.67 
 
 
884 aa  362  8e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
429 aa  286  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
432 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
432 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
432 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
432 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
432 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
432 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
438 aa  277  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
432 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
444 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
424 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
434 aa  267  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
438 aa  264  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
429 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
445 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.14 
 
 
441 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
424 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
429 aa  256  6e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
438 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
433 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
428 aa  250  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
423 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
428 aa  249  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  40.54 
 
 
447 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
439 aa  243  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.56 
 
 
437 aa  242  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
429 aa  237  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.84 
 
 
430 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
429 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
428 aa  234  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
428 aa  234  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 
434 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
429 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  39.34 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
434 aa  221  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
434 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
421 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
436 aa  219  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
436 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
431 aa  186  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
431 aa  183  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
432 aa  180  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
433 aa  173  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
440 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
431 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
441 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 
431 aa  170  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
431 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
430 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 
430 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
440 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  28.37 
 
 
574 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
447 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
435 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
430 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
429 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
442 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
434 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  27.46 
 
 
553 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 
430 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 
430 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
432 aa  154  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 
432 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
432 aa  152  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 
430 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
434 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
449 aa  144  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
434 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
434 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01390  asparagine-tRNA ligase, putative  26.14 
 
 
600 aa  133  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>