More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01390 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01390  asparagine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 600 aa  1229    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.399883  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  52.46 
 
 		 553 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  53.42 
 
 		 574 aa  595  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 431 aa  266  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 431 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 432 aa  261  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 431 aa  253  9.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 430 aa  250  7e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 431 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 430 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 431 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 433 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 430 aa  232  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 432 aa  229  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 440 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 434 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 434 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 434 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 441 aa  217  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 430 aa  216  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 430 aa  216  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 430 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 432 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 441 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 434 aa  209  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 434 aa  208  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 430 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 434 aa  207  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  30 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 447 aa  203  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 434 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 432 aa  200  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 465 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 428 aa  194  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 429 aa  194  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 		 429 aa  192  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 430 aa  190  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 466 aa  187  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 464 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 466 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 466 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf850  asparaginyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 450 aa  184  6e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 434 aa  183  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 454 aa  183  9.000000000000001e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1926  asparaginyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 466 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 429 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 439 aa  180  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 462 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 481 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 473 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 464 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0408  asparaginyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 467 aa  176  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 467 aa  175  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 466 aa  174  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>