More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1884 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
423 aa  857    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  83.45 
 
 
423 aa  731    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 
439 aa  518  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
429 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
432 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
432 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
432 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
432 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
432 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
432 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
432 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
432 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  47.18 
 
 
428 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.39 
 
 
441 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
433 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.11 
 
 
430 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.08 
 
 
437 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
424 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
424 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
430 aa  319  6e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
438 aa  319  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
430 aa  319  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  43.62 
 
 
447 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
438 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
429 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
434 aa  310  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
438 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
429 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
429 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
432 aa  296  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
443 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
429 aa  292  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
444 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
434 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
434 aa  282  9e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
421 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
434 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
428 aa  266  7e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
434 aa  262  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
429 aa  260  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
436 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
428 aa  253  6e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
429 aa  250  4e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
573 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
428 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  33.56 
 
 
567 aa  246  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
430 aa  239  9e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
436 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  35.49 
 
 
491 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  37.77 
 
 
579 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  33.41 
 
 
884 aa  222  8e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  36.8 
 
 
555 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  32.41 
 
 
956 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  33.04 
 
 
460 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
431 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
440 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
430 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
441 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
431 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
441 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
431 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
430 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
430 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
431 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
442 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
432 aa  189  5.999999999999999e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
430 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
433 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
431 aa  189  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
434 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 
430 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
435 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
447 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
448 aa  186  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
435 aa  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  30.54 
 
 
553 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  30.8 
 
 
574 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 
449 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2720  asparaginyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1028  asparaginyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00241255  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>