More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_42051 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  100 
 
 
579 aa  1194    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  54.55 
 
 
491 aa  551  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  47.43 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
573 aa  466  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41016  predicted protein  52.34 
 
 
460 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  42.47 
 
 
956 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  45.45 
 
 
555 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  37.73 
 
 
884 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
432 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
432 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
429 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
432 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
432 aa  252  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
432 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
429 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
444 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
432 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
432 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
432 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
434 aa  246  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
438 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
438 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
438 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
438 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
438 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
424 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
430 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
433 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
428 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
429 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
421 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
443 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
428 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
423 aa  227  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
445 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
436 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
423 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
439 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  40.43 
 
 
447 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  30.57 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
429 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.4 
 
 
430 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
429 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
434 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
430 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  39.2 
 
 
428 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
428 aa  208  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
434 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  31.28 
 
 
437 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
434 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
430 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 
429 aa  197  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
429 aa  190  8e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
436 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
434 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
431 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 
431 aa  180  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
433 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
431 aa  177  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
430 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
430 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
430 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
430 aa  167  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
441 aa  167  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 
432 aa  164  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
429 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 
432 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1358  asparaginyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
434 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
430 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0232  asparaginyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
440 aa  157  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
431 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 
431 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0885  asparaginyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 
440 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
449 aa  153  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
447 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
432 aa  151  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
431 aa  150  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
448 aa  150  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2363  asparaginyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
447 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00696467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1459  asparaginyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
431 aa  147  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 
463 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
463 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1677  asparaginyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
435 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
467 aa  145  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>