More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1998 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4506  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.63 
 
 		 641 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2037  polysaccharide biosynthesis protein CapD  96.43 
 
 		 675 aa  1170    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2312  polysaccharide biosynthesis protein CapD  95.99 
 
 		 657 aa  1170    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623811  normal  0.165216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5666  putative polysaccharide biosynthesis protein  55.38 
 
 		 637 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.811762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1604  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.93 
 
 		 651 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1642  polysaccharide biosynthesis protein CapD  75.8 
 
 		 662 aa  885    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472586  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4163  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.72 
 
 		 643 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737802  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  81.29 
 
 		 670 aa  827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1616  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.62 
 
 		 638 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1300  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.29 
 
 		 642 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0455  polysaccharide biosynthesis protein CapD  77.62 
 
 		 653 aa  876    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.70203  normal  0.0478579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1998  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 657 aa  1293    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.77 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0931663  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2799  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.17 
 
 		 633 aa  595  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.55 
 
 		 652 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4568  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.9 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.730165  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0248  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.22 
 
 		 664 aa  334  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.250562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  38.7 
 
 		 635 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.27 
 
 		 635 aa  328  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.96 
 
 		 626 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.98 
 
 		 614 aa  323  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1040  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.38 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.28 
 
 		 644 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.29 
 
 		 610 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  37.83 
 
 		 635 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  34.89 
 
 		 635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.04 
 
 		 613 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.89 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.44 
 
 		 612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.59 
 
 		 637 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.88 
 
 		 620 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.89 
 
 		 637 aa  302  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.85 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 604 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  32.33 
 
 		 603 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.37 
 
 		 635 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.1 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 614 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.15 
 
 		 607 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.68 
 
 		 638 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.77 
 
 		 612 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.75 
 
 		 613 aa  290  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.64 
 
 		 647 aa  290  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 647 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  37.63 
 
 		 614 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.16 
 
 		 609 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.09 
 
 		 643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.84 
 
 		 642 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.35 
 
 		 628 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.98 
 
 		 630 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.52 
 
 		 670 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  34.91 
 
 		 615 aa  281  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.67 
 
 		 676 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.54 
 
 		 627 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.23 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.69 
 
 		 607 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.56 
 
 		 611 aa  277  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.24 
 
 		 627 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.16 
 
 		 633 aa  276  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.56 
 
 		 651 aa  276  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.43 
 
 		 627 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.43 
 
 		 627 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.43 
 
 		 627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  36.71 
 
 		 621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.97 
 
 		 646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.53 
 
 		 625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.48 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  36.14 
 
 		 625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1354  putative epimerase/dehydratase WbiI  30.57 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  36.55 
 
 		 621 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.6 
 
 		 652 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.96 
 
 		 680 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.59 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.55 
 
 		 655 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.68 
 
 		 619 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  35.34 
 
 		 656 aa  270  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.43 
 
 		 656 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.73 
 
 		 648 aa  270  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.19 
 
 		 653 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.56 
 
 		 613 aa  267  5e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.73 
 
 		 627 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4459  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.68 
 
 		 641 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.11 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  33.28 
 
 		 649 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.87 
 
 		 646 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.99 
 
 		 647 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.72 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0697  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.68 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0510  epimerase/dehydratase, putative  35.78 
 
 		 622 aa  261  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.798384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.4 
 
 		 660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.93 
 
 		 682 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  42.39 
 
 		 644 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>