52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0912 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  718    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  41.18 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  29.92 
 
 
377 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  29.17 
 
 
377 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  29.71 
 
 
361 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  28.45 
 
 
361 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.28 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  30.45 
 
 
377 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  29.33 
 
 
359 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  33.08 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  28.25 
 
 
392 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  27.03 
 
 
361 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  26.53 
 
 
373 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  25.34 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.09 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  34.22 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  25.82 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  26.69 
 
 
365 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  25.29 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  28.35 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  25.8 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  33.77 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  25.15 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  33.94 
 
 
444 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  23.72 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  24.15 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  32.54 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  23.53 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  23.12 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.17 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  25.1 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  28.95 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  30.4 
 
 
381 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  26.71 
 
 
406 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  31.2 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  22.96 
 
 
268 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  23.86 
 
 
503 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  23.74 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  23.13 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  25.51 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  27.17 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  29.41 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  26.25 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  27.17 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  22.27 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  42 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  24.04 
 
 
553 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  29.13 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  25.58 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  21.62 
 
 
389 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  28.16 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  28.57 
 
 
556 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>