39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3571 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  43.37 
 
 
378 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  38.26 
 
 
377 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  31.86 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  32.44 
 
 
391 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  31.55 
 
 
393 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  30.12 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  29.77 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  31.1 
 
 
556 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  30.65 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  29.36 
 
 
406 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  28.27 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  29.07 
 
 
406 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  30.68 
 
 
565 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  30.68 
 
 
565 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  30.97 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  27.99 
 
 
381 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  28.67 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  26.59 
 
 
503 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  27.46 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.24 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  26.53 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  27.5 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  23.72 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  23.42 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  27.74 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  24.05 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  24.1 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  24.14 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  29.37 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  26.24 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  24.03 
 
 
375 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  27.83 
 
 
372 aa  46.2  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  30.43 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  24.4 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  23.4 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  29.25 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.82 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>