46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1258 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  721    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  41.18 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  30.64 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  29.36 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  29.05 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  29.12 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  26.05 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  29.74 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  28.31 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  28.21 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  29.21 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  36.71 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  36.65 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  27.37 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  27.56 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  26.84 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  26.32 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  40.43 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  27.16 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  29.29 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  28.65 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  31.79 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  23.42 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.71 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  34.82 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  27.44 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  31.45 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.11 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  28.23 
 
 		 391 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  25.41 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  24.84 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  30.97 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  26.24 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  28.67 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  29.2 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  25.52 
 
 		 503 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  28.8 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  29.09 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  30.71 
 
 		 406 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  29.6 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  27.56 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  24.81 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  30.88 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>