26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2250 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  80.83 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  64.75 
 
 		 373 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  61.65 
 
 		 369 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  61.07 
 
 		 371 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  56.87 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  59.92 
 
 		 369 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  36.53 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  34.47 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  33.83 
 
 		 361 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  35.47 
 
 		 361 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  35.98 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  31.42 
 
 		 359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.3 
 
 		 377 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  31.32 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  31.76 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  24.74 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  22.96 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  30.65 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  31.25 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  36.78 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  25.09 
 
 		 406 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.09 
 
 		 363 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.72 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.38 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>