28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0135 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  41.3 
 
 		 377 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  39.61 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  32.04 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.84 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  30.63 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  30.61 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  30.91 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  30.91 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  34.55 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  28.62 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  31.21 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  26.11 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  33.55 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  28.18 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  29.47 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  25.15 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  29.02 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  31.54 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  25.91 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  30.91 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.09 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  27.75 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>