43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0882 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  734    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  40.66 
 
 
406 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  29 
 
 
365 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  27.97 
 
 
409 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  24.36 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  31.03 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  25.65 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  27.04 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  25.56 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  26.81 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  23.71 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.75 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  25.68 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  23.17 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  24.28 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  21.7 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  28.93 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  26.27 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  31.87 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  29.22 
 
 
503 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  25.32 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  23.75 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  27.37 
 
 
553 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  23.15 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  22.71 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  28.52 
 
 
398 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  24.33 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  23.57 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  26.02 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  28.08 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  34.07 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  27.13 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  31.96 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  26.35 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  32.67 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  29.23 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  25.14 
 
 
565 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  25.14 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  28.79 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  23.38 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  27.97 
 
 
556 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  30 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>