35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1332 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1089    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  65.12 
 
 
486 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  70.45 
 
 
391 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  70.45 
 
 
393 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  70.18 
 
 
391 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  68.34 
 
 
391 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  66.93 
 
 
389 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  43.99 
 
 
406 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  46.04 
 
 
406 aa  260  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  43.6 
 
 
565 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  43.34 
 
 
565 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  42.67 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  41.18 
 
 
503 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  36.7 
 
 
381 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  38.24 
 
 
380 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  39.53 
 
 
380 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  39.49 
 
 
376 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  39.1 
 
 
377 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  32.57 
 
 
382 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  34.47 
 
 
377 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  33.03 
 
 
378 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  31.1 
 
 
377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  24.68 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  31.45 
 
 
363 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  24.35 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  27 
 
 
371 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.53 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  36.46 
 
 
335 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  28.48 
 
 
361 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  25.64 
 
 
361 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  31.45 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  30.6 
 
 
398 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  28.72 
 
 
371 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  27.97 
 
 
363 aa  43.5  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>