45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0476 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  62.05 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  61.73 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  37.6 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  37.36 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  35.28 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  35.77 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  35.64 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  35.21 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  35.11 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  34.37 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  34.73 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  32.77 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  31.04 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  34.83 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  35.47 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  30.63 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.05 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  29.71 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  29.38 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  36.08 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  39.52 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  27.04 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  34.59 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  25.88 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  31.41 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  26.7 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  27.43 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  26.07 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  28.48 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  24.1 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  31.87 
 
 		 444 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  28.48 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  31.08 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  25.65 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  26.77 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  29.07 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  30.43 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  29.35 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  26.7 
 
 		 486 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  27.87 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  30.66 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>