36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3551 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  82.21 
 
 		 371 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  74.39 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  63.88 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  67.21 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  56.67 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  61.07 
 
 		 268 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  34.44 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  35.64 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.52 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  35.2 
 
 		 370 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  33.7 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  35.51 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.32 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  34.16 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  31.69 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  30.91 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.21 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  33.77 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  30.32 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  26.69 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  24.51 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  33.08 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  25.23 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  27.41 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.75 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.73 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  33.87 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  31.39 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  27.52 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  27.85 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  28.11 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  44.78 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  30.43 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  43.28 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  29.92 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>