40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0494 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  85.68 
 
 		 377 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  756    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  40.5 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  39.61 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  34.08 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  32.21 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  35.56 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.54 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  33.7 
 
 		 371 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  34.37 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  33.61 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  33.51 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  34.2 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  32.43 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  33.24 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  32.34 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  29.17 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.36 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.35 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  29.69 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  25.65 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  34.29 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  26.8 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.45 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.17 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  26.92 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  26.43 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  27.11 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  24.81 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  23.5 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  32.56 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  26.24 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  32.41 
 
 		 553 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  31.88 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  30.38 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  29.84 
 
 		 503 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  26.75 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  33.9 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  30.47 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>