42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0444 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  70.19 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  62.05 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  36.71 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  36.87 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  33.62 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  35.83 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  34.44 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.98 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  34.45 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  35.47 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  32.21 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.49 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  35.46 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.6 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  35.98 
 
 		 268 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  26.11 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  28.45 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.12 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  33.5 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  25.98 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  24.36 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.24 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  25.31 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  23.7 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  32.56 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  23.6 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  24.27 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  28.09 
 
 		 565 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  27.53 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  24.84 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  27.01 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  30.43 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  25.64 
 
 		 556 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  30.43 
 
 		 349 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  24.36 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  25.93 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  23.08 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  27.11 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  29.25 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>