38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2187 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  87.66 
 
 		 393 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  76.88 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  77.57 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  76.61 
 
 		 389 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  70.91 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  70.18 
 
 		 556 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  44.5 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  46.67 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  44.17 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  44.44 
 
 		 553 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  43.63 
 
 		 565 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  40 
 
 		 503 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  37.42 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  37.01 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  38.33 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  37.01 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  32.44 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  34.52 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  34.83 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  32.04 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.23 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  26.59 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.03 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.71 
 
 		 444 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  27.81 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.25 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  28.38 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  28.8 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  30.47 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  23.08 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  27.13 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  27.73 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  34.38 
 
 		 335 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>