33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1841 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  94.13 
 
 
380 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  53.46 
 
 
382 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  50.81 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  45.6 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  40.13 
 
 
406 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  40.33 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  36.39 
 
 
391 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  37.83 
 
 
486 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  35.85 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  37.39 
 
 
503 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  39.06 
 
 
406 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  36.7 
 
 
556 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  36.99 
 
 
553 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  37.66 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  36.99 
 
 
565 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  35.05 
 
 
389 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  36.68 
 
 
565 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  37.01 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  31.53 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  30.45 
 
 
377 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.43 
 
 
378 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  27.99 
 
 
377 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  32.33 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.15 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  30.4 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  27.44 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  32.37 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  31.25 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  31.71 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  29.23 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  32.52 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.94 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>