35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1744 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  63.88 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  68.6 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  63.17 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  63.44 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  61.52 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  64.75 
 
 		 268 aa  342  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  37.6 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  36.87 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.16 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  35.24 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  37.01 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.88 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  32.43 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.71 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.53 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  31.21 
 
 		 355 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.53 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  27.56 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  33.17 
 
 		 335 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  30.99 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  29.14 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  31.51 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.3 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  25.91 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  21.7 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  26.59 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  22.69 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  25.99 
 
 		 444 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  30.71 
 
 		 352 aa  49.7  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  25.5 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  25.56 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  24.15 
 
 		 486 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>