36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2266 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  80.35 
 
 		 565 aa  833    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  100 
 
 		 553 aa  1042    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  80.18 
 
 		 565 aa  837    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  60.16 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  59.42 
 
 		 406 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  48.5 
 
 		 503 aa  349  9e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  43.47 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  42.93 
 
 		 486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  44.44 
 
 		 391 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  42.67 
 
 		 556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  44.8 
 
 		 389 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  43.01 
 
 		 393 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  40.54 
 
 		 391 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  36.99 
 
 		 381 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  36.99 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  34.36 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  35.58 
 
 		 380 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  34.18 
 
 		 376 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  37.85 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  31.44 
 
 		 377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  30.97 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  29.25 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  27 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  28.14 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  31.63 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  27.37 
 
 		 363 aa  53.9  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  29.85 
 
 		 406 aa  50.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  31.37 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  27.01 
 
 		 361 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  32.41 
 
 		 377 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  34.11 
 
 		 377 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  24.04 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  30.47 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.71 
 
 		 444 aa  43.9  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  30.81 
 
 		 335 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>