54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3364 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  31.72 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  27.97 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3210  hypothetical protein  31.47 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325243  normal  0.217196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  27.68 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  31.13 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  25.28 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  25.07 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  28.21 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  27.25 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  26.35 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  26.84 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  26.23 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  24.68 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  26.24 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  25.19 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  25.97 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  24 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  25.24 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  25.31 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  25.22 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  25.55 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  34.84 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  27 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.49 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  26.58 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  26.17 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  30.21 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  28.8 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  24.51 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  25.74 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  26.15 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  30.07 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  34.59 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  24.62 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  25.81 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  29.14 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  27.96 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  26 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  25.1 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  25.75 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  31.65 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  24.74 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  22.55 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  27.67 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  25.86 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  26.09 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  40.28 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  41.27 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  32 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>